زیرگروه مهندسی سلول پژوهشگاه رویان در سال 1389 آغاز به کار کرد. هدف از شکل گیری این زیر گروه، پیوند علوم مهندسی و زیستی به منظور بهبود روش های کشت سلولهای بنیادی و شرایط پیوند برای کاربردهای سلولهای درمانی بوده است. تعامل تنگاتنگ مهندسان با متخصصان فناوری سلولهای بنیادی، تربیت افرادی با دانش چند جنبه ای را سبب شده است که هم در زمینه علوم مهندسی و هم علم زیست شناسی و طب ترمیمی، آموزش های عمیق دیده باشند و بتوانند با بکارگیری ابزارهای علم مهندسی، مسیر کاربرد زیست شناسی را به سمت طب ترمیم هموار کنند. در این راستا این گروه به فراخور نیازهای روز تحقیقات سلولهای بنیادی، با تکیه بر اصول مهندسی، به طراحی ، ساخت و ارزیابی زیست مواد و همچنین توسعه فرآیندهای زیستی همت گماشته است.